VMD(Visual Merchandising)是一種分子可視化程序,可以顯示、動(dòng)畫(huà)演示和分析大的生物分子體系。VMD專(zhuān)為建模,可視化和分析生物系統(tǒng)(例如蛋白質(zhì),核酸,脂質(zhì)雙層組件等)而設(shè)計(jì)。由于VMD可以讀取標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)(PDB)文件并顯示,因此可用于查看更通用的分子包含的結(jié)構(gòu)。
VMD軟件特色
VMD提供了多種用于渲染和著色分子的方法:簡(jiǎn)單的點(diǎn)和線,CPK球體和圓柱體,甘草鍵,主干管和色帶,卡通繪圖等。VMD可用于對(duì)分子動(dòng)力學(xué)(MD)模擬的軌跡進(jìn)行動(dòng)畫(huà)處理和分析。特別是,VMD可以通過(guò)在遠(yuǎn)程計(jì)算機(jī)上顯示和模擬分子來(lái)充當(dāng)外部MD程序的圖形前端。
?VMD軟件亮點(diǎn)
VMD具有廣泛的應(yīng)用領(lǐng)域,它不僅可以用于生物化學(xué)領(lǐng)域,還可以用于材料科學(xué)、藥學(xué)、化學(xué)等領(lǐng)域。它可以幫助科學(xué)家們更好地理解分子的結(jié)構(gòu)和動(dòng)態(tài)行為,從而更好地設(shè)計(jì)和開(kāi)發(fā)新的藥物或材料。
VMD是一種強(qiáng)大的分子可視化軟件,可以用于顯示、動(dòng)畫(huà)演示和分析大的生物分子體系。它具有廣泛的應(yīng)用領(lǐng)域,可以幫助科學(xué)家們更好地理解和設(shè)計(jì)新的藥物或材料。